Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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