Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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