Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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