Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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