Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
STX4Q12846 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
STX4Q12846 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
STX4Q12846 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
STX4Q12846 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
STX4Q12846 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms