Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPEQ02224 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms