Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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PTPRBP23467 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRBP23467 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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