Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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