Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
APOBEC3GQ9HC16 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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