Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms