Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CRELD1Q96HD1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms