Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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