Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CHCHD4Q8N4Q1 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CHCHD4Q8N4Q1 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CHCHD4Q8N4Q1 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CHCHD4Q8N4Q1 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CHCHD4Q8N4Q1 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CHCHD4Q8N4Q1 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHCHD4Q8N4Q1 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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