Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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RTN1Q16799 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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