Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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