Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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