Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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