Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SCARF1Q14162 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SCARF1Q14162 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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