Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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