Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDE6HQ13956 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms