Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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