Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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