Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BFSP2Q13515 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms