Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms