Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3BQ13214 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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