Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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