Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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CNTN1Q12860 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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