Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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BPTFQ12830 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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BPTFQ12830 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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BPTFQ12830 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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BPTFQ12830 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
BPTFQ12830 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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