Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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