Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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