Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms