Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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