Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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