Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ARXQ96QS3 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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