Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms