Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms