Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms