Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DUSP6Q16828 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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