Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PCSK7Q16549 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PCSK7Q16549 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PCSK7Q16549 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms