Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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CNGA3Q16281 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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