Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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E2F4Q16254 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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