Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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GRIK4Q16099 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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GRIK4Q16099 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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GRIK4Q16099 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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GRIK4Q16099 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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