Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHHQ15465 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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