Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRKQ15262 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms