Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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LAPTM4AQ15012 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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LAPTM4AQ15012 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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LAPTM4AQ15012 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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LAPTM4AQ15012 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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