Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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