Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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ERV3-1Q14264 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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ERV3-1Q14264 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ERV3-1Q14264 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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