Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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