Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RUNX3Q13761 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms