Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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